Mecanismo de reconocimiento de un epítope intrínsecamente desordenado por un anticuerpo monoclonal : integración mecanística y estructural

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El reconocimiento de antígenos por medio de anticuerpos es un eventofundamental en la respuesta inmune adaptativa. A su vez la formación de los complejos Antígeno:Anticuerpo es extensivamente utilizada como modelo de estudio de interacciónproteína-proteína. En la presente tesis estudiamos el mecanis...

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Detalles Bibliográficos
Autor principal: Fassolari, Marisol
Formato: Tesis Doctoral
Lenguaje:Español
Publicado: 2014
Materias:
ONCOPROTEINA E7
ANTIGENO
ANTICUERPO
SELECCION CONFORMACIONAL
ISOMERIZACION DE PROLINAS
PROTEINAS INTRINSECAMENTE DESORDENADAS
E7 ONCOPROTEIN
ANTIGEN
ANTIBODY
CONFORMATIONAL SELECTION
PROLYL ISOMERIZATION
INTRINSICALLY DISORDERED PROTEINS
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5629_Fassolari
Aporte de:
Biblioteca Digital - Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA) de Universidad de Buenos Aires
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description El reconocimiento de antígenos por medio de anticuerpos es un eventofundamental en la respuesta inmune adaptativa. A su vez la formación de los complejos Antígeno:Anticuerpo es extensivamente utilizada como modelo de estudio de interacciónproteína-proteína. En la presente tesis estudiamos el mecanismo de reconocimiento de unanticuerpo monoclonal específico, M1, por la proteína E7 del papilomavirus humano (HPV). E7 es la oncoproteína que constituye la principal actividad transformante del virus y además esparadigma de proteínas intrínsecamente desordenadas (IDP). E7 se expresa constitutivamente entejidos de carcinoma y la aparición de anticuerpos específicos ocurre con alta frecuencia enpacientes con cáncer cervical. Llevando a cabo un mapeo epitópico determinamos que elanticuerpo M1 reconoce específicamente una región inmunodominante de la proteína de HPV- 16 denominada “bisagra”, por conectar el dominio IDP N-terminal con el dominio globular Cterminalde la misma. Experimentos cinéticos mostraron que la región reconocida por M1, lacual posee dos residuos de prolina, comprende al menos dos poblaciones separadas por una altabarrera energética (~ 22 Kcal/mol). Los estudios de Resonancia Magnética Nuclear identificaronel origen de esta barrera como un evento de isomerización cis-trans de las prolinas presentes enel epítope de reconocimiento. Se determinó que el anticuerpo M1 reconoce específicamente alepítope en su conformación minoritaria (10%), que posee sus prolinas en cis, mediante elmecanismo de selección conformacional. Por lo tanto, se requiere que el 90% de las moléculasque se encuentran en configuración trans isomericen previo a la unión con el anticuerpo. Lavelocidad de asociación del conformero cis por M1 ( kon = 6 x 107 M-1 s-1) se encuentra entre lasmás rápidas para las interacciones Antígeno:Anticuerpo, a pesar de que la reacción global esextremadamente lenta (t1/2 ~ 4 min). Esto indica que la reacción de asociación se encuentralimitada por un evento de isomerización de prolina. Utilizando mutantes puntualesdemostramos que la P41 en su conformación cis es la requerida para la unión con el anticuerpo. Luego del evento lento de pre-equilibrio y de la unión con M1, ocurre un evento de rearreglounimolecular, formándose finalmente un complejo consolidado de alta afinidad (KD 120 nM). Nuestros resultados sugieren que la presentación de este epítope viral por las célulaspresentadoras de antígeno tiene que haber estado en su configuración minoritaria cis, al generarel clon que produce el anticuerpo específico. Finalmente, mostramos la importancia de losdeterminantes estructurales presentes en regiones desordenadas en el reconocimiento entremacromoléculas. Dado que numerosas proteínas virales son multifuncionales debido a sunaturaleza IDP, los resultados presentados en esta tesis sientan la bases para el análisis delmecanismo de reconocimiento por medio de anticuerpos de epítopes virales intrínsecamentedesordenados.
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spelling todo:tesis_n5629_Fassolari2023-10-03T12:59:17Z Mecanismo de reconocimiento de un epítope intrínsecamente desordenado por un anticuerpo monoclonal : integración mecanística y estructural Recognition mechanism of an intrinsically disordered epitope by a monoclonal antibody: mechanistic and structural integration Fassolari, Marisol ONCOPROTEINA E7 ANTIGENO ANTICUERPO SELECCION CONFORMACIONAL ISOMERIZACION DE PROLINAS PROTEINAS INTRINSECAMENTE DESORDENADAS E7 ONCOPROTEIN ANTIGEN ANTIBODY CONFORMATIONAL SELECTION PROLYL ISOMERIZATION INTRINSICALLY DISORDERED PROTEINS El reconocimiento de antígenos por medio de anticuerpos es un eventofundamental en la respuesta inmune adaptativa. A su vez la formación de los complejos Antígeno:Anticuerpo es extensivamente utilizada como modelo de estudio de interacciónproteína-proteína. En la presente tesis estudiamos el mecanismo de reconocimiento de unanticuerpo monoclonal específico, M1, por la proteína E7 del papilomavirus humano (HPV). E7 es la oncoproteína que constituye la principal actividad transformante del virus y además esparadigma de proteínas intrínsecamente desordenadas (IDP). E7 se expresa constitutivamente entejidos de carcinoma y la aparición de anticuerpos específicos ocurre con alta frecuencia enpacientes con cáncer cervical. Llevando a cabo un mapeo epitópico determinamos que elanticuerpo M1 reconoce específicamente una región inmunodominante de la proteína de HPV- 16 denominada “bisagra”, por conectar el dominio IDP N-terminal con el dominio globular Cterminalde la misma. Experimentos cinéticos mostraron que la región reconocida por M1, lacual posee dos residuos de prolina, comprende al menos dos poblaciones separadas por una altabarrera energética (~ 22 Kcal/mol). Los estudios de Resonancia Magnética Nuclear identificaronel origen de esta barrera como un evento de isomerización cis-trans de las prolinas presentes enel epítope de reconocimiento. Se determinó que el anticuerpo M1 reconoce específicamente alepítope en su conformación minoritaria (10%), que posee sus prolinas en cis, mediante elmecanismo de selección conformacional. Por lo tanto, se requiere que el 90% de las moléculasque se encuentran en configuración trans isomericen previo a la unión con el anticuerpo. Lavelocidad de asociación del conformero cis por M1 ( kon = 6 x 107 M-1 s-1) se encuentra entre lasmás rápidas para las interacciones Antígeno:Anticuerpo, a pesar de que la reacción global esextremadamente lenta (t1/2 ~ 4 min). Esto indica que la reacción de asociación se encuentralimitada por un evento de isomerización de prolina. Utilizando mutantes puntualesdemostramos que la P41 en su conformación cis es la requerida para la unión con el anticuerpo. Luego del evento lento de pre-equilibrio y de la unión con M1, ocurre un evento de rearreglounimolecular, formándose finalmente un complejo consolidado de alta afinidad (KD 120 nM). Nuestros resultados sugieren que la presentación de este epítope viral por las célulaspresentadoras de antígeno tiene que haber estado en su configuración minoritaria cis, al generarel clon que produce el anticuerpo específico. Finalmente, mostramos la importancia de losdeterminantes estructurales presentes en regiones desordenadas en el reconocimiento entremacromoléculas. Dado que numerosas proteínas virales son multifuncionales debido a sunaturaleza IDP, los resultados presentados en esta tesis sientan la bases para el análisis delmecanismo de reconocimiento por medio de anticuerpos de epítopes virales intrínsecamentedesordenados. Recognition of antigens by antibodies is a critical event in the adaptive immune response. Furthermore, the Antigen:Antibody complex is extensively used as a model of protein-proteininteractions. In the present thesis, we present a detailed mechanistic study of the interaction between aspecific monoclonal antibody, M1, with the E7 oncoprotein of human papillomavirus. E7 is the maintransforming factor of this virus and also emerges as a paradigmatic example of an intrinsicallydisordered protein or IDP. E7 is constitutively expressed at high levels in carcinoma tissues andantibodies are frequently raised in patients with cervical cancer. Epitope mapping studies reveal that the M1 antibody specifically recognizes an immunodominant region of the HPV-16 E7 protein called "hinge", located between the IDP N-terminal and the globular C-terminal domains of the protein. Kineticexperiments show that this hinge, which has two proline residues, has at least two populations separatedby a high energy barrier (~ 22 kcal / mol). Nuclear magnetic resonance traced the origin of this barrier toa very slow trans/cis prolyl isomerization event present in E7 epitope. The less populated (10%) cisisomer is the binding-competent species. Thus, the 90% of the molecules in the trans configurationrequire isomerization before binding. The association rate for the cis isomer approaches 6x107 M-1s-1, aceiling for antigen-antibody interactions, although the overall reaction is extremely slow (t1/2 ~ 4 min). Therefore, the E7 epitope:M1 antibody complex formation is limited by a proline isomerization event. Mutagenesis experiments showed that Pro 41 in the epitope was required for both binding andisomerization. After the slow pre-equilibrium event and M1 binding, a post-binding unimolecular eventoccurs and a consolidated complex with a KD = 1.2!10-7 M is reached. Our results suggest thatpresentation of this viral epitope by the antigen presenting cells would have to be “locked” in the cisconformation in opposition to the most populated trans isomer in order to select the specific antibodyclone. Finally, we show the importance of the structural determinants within disordered regions in therecognition mechanism between macromolecules. Many viral proteins are multifunctional due to its IDPnature. Therefore, the results presented in this thesis establish the basis for the analysis of the recognitionmechanism by antibodies of intrinsically disordered viral epitopes. Fil: Fassolari, Marisol. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. 2014 Tesis Doctoral PDF Español info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5629_Fassolari

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