Epidemiología molecular del virus linfotrópico T-humano tipo 1 (HTLV-1) en Argentina : análisis étnico-geográfico y variabilidad viral

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El objetivo principal de esta tesis fue profundizar los conocimientos sobre la infección por HTLV-1 en Argentina. Con tal fin, se estimó la prevalencia de infección en comunidades originarias de las provincias de Jujuy, San Juan, Misiones, Formosa y Chaco, detectándose una prevalencia en Kollas de 9...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor principal: Eirin, María Emilia
Formato: Tesis Doctoral
Lenguaje:Español
Publicado: 2011
Materias:
HTLV-1
EPIDEMIOLOGIA
FILOGENIA
VARIABILIDAD GENOMICA Y ORIGEN ETNICO
EPIDEMIOLOGY
PHYLOGENY
GENOMIC VARIABILITY AND ETHNIC ORIGIN
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n4882_Eirin
Aporte de:
Biblioteca Digital - Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA) de Universidad de Buenos Aires
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description El objetivo principal de esta tesis fue profundizar los conocimientos sobre la infección por HTLV-1 en Argentina. Con tal fin, se estimó la prevalencia de infección en comunidades originarias de las provincias de Jujuy, San Juan, Misiones, Formosa y Chaco, detectándose una prevalencia en Kollas de 9.8% que confirmó un área naturalmente endémica en Jujuy con una restricción étnico-geográfica ya descripta. El análisis filogenético determinó que las secuencias HTLV-1, tanto de Jujuy como de Buenos Aires, eran subtipo Cosmopolita subgrupo Transcontinental (aA) a excepción de dos, cuyas muestras provenían de individuos residentes de Buenos Aires nacidos en Perú (Neu2 y Neu6) que fueron clasificados en un nuevo subgrupo denominado F. Por otro lado, se detectaron 4 secuencias evolutivamente relacionadas con referencias de Sudáfrica, demostrando la circulación de cepas virales de origen africano en Buenos Aires. Al estudiar el origen étnico de los individuos HTLV-1 positivos, se evidenció la presencia de un componente autóctono predominante, detectándose los cuatro haplogrupos panamericanos (A2, B2, C1, D1) en los Kollas y en el 73% de los residentes de Buenos Aires. En el resto se identificaron haplogrupos alóctonos con un 17,9% de origen Euroasiático Occidental (H, J, T, U, N1b), un 4,5% de origen Africano (L0 y L1) y un 1,5% de origen Asiático Oriental (M7a). Las cepas clasificadas filogenéticamente como de origen africano pertenecieron a individuos con haplogrupo B2 amerindio, mientras que una secuencia de Buenos Aires que agrupó junto a las de Jujuy provenía de un donante con haplogrupo de origen africano. Estos datos sugieren el contacto entre estas poblaciones y sustenta la hipótesis de introducción de la infección con la llegada de esclavos africanos en la época pos-colombina. El análisis in sílico de las secuencias LTR reveló una menor variabilidad en individuos asintomáticos en comparación con pacientes con HAM/TSP y ATL(p menor 0,05), mientras que la variabilidad de la proteína viral Tax fue significativamente menor en secuencias de portadores de Jujuy que en individuos asintomáticos o con enfermedad de Buenos Aires. De todos modos, no se detectó un polimorfismo determinado asociado con la presencia de patología.
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El análisis filogenético determinó que las secuencias HTLV-1, tanto de Jujuy como de Buenos Aires, eran subtipo Cosmopolita subgrupo Transcontinental (aA) a excepción de dos, cuyas muestras provenían de individuos residentes de Buenos Aires nacidos en Perú (Neu2 y Neu6) que fueron clasificados en un nuevo subgrupo denominado F. Por otro lado, se detectaron 4 secuencias evolutivamente relacionadas con referencias de Sudáfrica, demostrando la circulación de cepas virales de origen africano en Buenos Aires. Al estudiar el origen étnico de los individuos HTLV-1 positivos, se evidenció la presencia de un componente autóctono predominante, detectándose los cuatro haplogrupos panamericanos (A2, B2, C1, D1) en los Kollas y en el 73% de los residentes de Buenos Aires. En el resto se identificaron haplogrupos alóctonos con un 17,9% de origen Euroasiático Occidental (H, J, T, U, N1b), un 4,5% de origen Africano (L0 y L1) y un 1,5% de origen Asiático Oriental (M7a). Las cepas clasificadas filogenéticamente como de origen africano pertenecieron a individuos con haplogrupo B2 amerindio, mientras que una secuencia de Buenos Aires que agrupó junto a las de Jujuy provenía de un donante con haplogrupo de origen africano. Estos datos sugieren el contacto entre estas poblaciones y sustenta la hipótesis de introducción de la infección con la llegada de esclavos africanos en la época pos-colombina. El análisis in sílico de las secuencias LTR reveló una menor variabilidad en individuos asintomáticos en comparación con pacientes con HAM/TSP y ATL(p menor 0,05), mientras que la variabilidad de la proteína viral Tax fue significativamente menor en secuencias de portadores de Jujuy que en individuos asintomáticos o con enfermedad de Buenos Aires. De todos modos, no se detectó un polimorfismo determinado asociado con la presencia de patología. The aim of this thesis was to gain an in-depth knowledge of HTLV-1 infection in Argentina. In order to achieve this, HTLV-1 prevalence was estimated in aboriginal populations of Jujuy, San Juan, Misiones, Formosa and Chaco provinces, yielding a 9.8% among Kollas and confirming a naturally endemic area in Jujuy, associated to an ethnic-geographic restriction as previously described. The phylogenetic analysis determined that HTLV-1 sequences, both from Jujuy and Buenos Aires, were Cosmopolitan subtype Transcontinental (aA) subgroup with the exception of two sequences belonging to residents of Buenos Aires city but born in Peru (Neu2 y Neu6) who were classified in a new subgroup named F. On the other hand, 4 sequences evolutionally related to South Africa were detected, demonstrating the presence of viral strains with African origin in Buenos Aires city. Regarding the ethnic origin of all HTLV-1 positive individuals, the presence of a predominant autochthonous component (Pan-American haplogroups A2, B2, C1, D1) was detected, being all four present in Kollas and in 73% of Buenos Aires inhabitants. In the other populations alloctonous haplogroups were identified with a 17,9% Occidental Eurasian origin (H, J, T, U, N1b), a 4,5% African origin (L0 y L1) and a 1,5% de Oriental Asian origin (M7a). The strains phylogenetically classified as African belonged to individuals with Amerindian B2 haplogroup, while a sequence from Buenos Aires which grouped together with sequences from Jujuy belonged to a blood donor with an African origin haplogroup. This data suggests contact between these populations and sustains the hypothesis of the introduction of HTLV-1 infection with the arrival of African slaves in the post-Columbian era. The analysis in sílico of LTR sequences revealed a lower variability in asymptomatic individuals compared to HAM/TSP and ATL patients (p < 0,05), while the variability of Tax viral protein was significantly lower in asymptomatic individuals from Jujuy compared to asymptomatic or HAM/TSP and ATL patients from Buenos Aires. Regardless this situation, not a specific polymorphism was detected in association to the presence of pathologies. Fil: Eirin, María Emilia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. 2011 Tesis Doctoral PDF Español info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n4882_Eirin

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