Regulación epigenética del splicing alternativo mediante RNAs pequeños y argonauta 1

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Los RNAs pequeños interferentes (siRNAs) son conocidos por mediar el silenciamiento post-transcripcional de genes (PTGS) promoviendo la degradación de mRNAs targets. Cuando son dirigidos contra regiones promotoras, los siRNAs participan en una vía alternativa conocida como silenciamiento transcripci...

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Detalles Bibliográficos
Autor principal: Alló, Mariano
Formato: Tesis Doctoral
Lenguaje:Español
Publicado: 2010
Materias:
SPLICING ALTERNATIVO
TRANSCRIPCION
CROMATINA INTRAGENICA
INTERFERENCIA POR RNA
SIRNAS
AGO1
TGS
ALTERNATIVE SPLICING
TRANSCRIPTION
INTRAGENIC CHROMATIN
RNA INTERFERENCE
AGO
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n4759_Allo
Aporte de:
Biblioteca Digital - Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA) de Universidad de Buenos Aires
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spelling todo:tesis_n4759_Allo2023-10-03T12:50:16Z Regulación epigenética del splicing alternativo mediante RNAs pequeños y argonauta 1 Epigenetic regulation of alternative splicing by means of small RNAs and argonaute 1 Alló, Mariano SPLICING ALTERNATIVO TRANSCRIPCION CROMATINA INTRAGENICA INTERFERENCIA POR RNA SIRNAS AGO1 TGS ALTERNATIVE SPLICING TRANSCRIPTION INTRAGENIC CHROMATIN RNA INTERFERENCE SIRNAS AGO Los RNAs pequeños interferentes (siRNAs) son conocidos por mediar el silenciamiento post-transcripcional de genes (PTGS) promoviendo la degradación de mRNAs targets. Cuando son dirigidos contra regiones promotoras, los siRNAs participan en una vía alternativa conocida como silenciamiento transcripcional de genes (TGS) que promueve la metilación de histonas, formación de heterocromatina e inhibición de la transcripción. Mostramos aquí que los siRNAs dirigidos contra secuencias ubicadas en cercanías al exón alternativo EDI del gen de la fibronectina son capaces de regular su splicing alternativo en celulas de mamíferos. El efecto necesita de dos proteínas claves de la vía de interferencia por RNA, AGO1 y AG02. Sin embargo, como sólo AGO1 es necesario para el TGS concluimos que ésta es la principal vía involucrada. Por otra parte, la importancia del estado de la cromatina ha sido resaltada al mostrar que los efectos son eliminados o reducidos por factores que favorecen una estructura cromatínica mas relajada o que aumentan la elongación de la transcripción. Más aun, el mecanismo involucra la presencia de marcas epigenéticas de heterocromatina facultativa (H3K9me2 y H3K27me3) intragénicas en la región target y la función de la proteína asociada a heterocromatina HP1alfa. Utilizando tecnología genome-wide encontramos que aproximadamente el 40% de los eventos de splicing alternativo contenidos en un panel de RT-PCR relacionado a cáncer fueron afectados tras la depleción de AGO1 o Dicer. Mediante experimentos de ChIP-seq hemos encontrado un enriquecimiento de clusters de AGO1 en promotores de genes con alta expresión y en exones ubicados en genes con baja tasa transcripcional. Adicionalmente, descubrimos un aumento del solapamiento de marcas de histonas sobre sitios target de AGO1. Finalmente, hemos detectado un evento de splicing alternativo endogeno del gen SYNE2 (exón 107) que podría estar siendo afectado fisiológicamente por AGO1. Fil: Alló, Mariano. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. 2010 Tesis Doctoral PDF Español info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n4759_Allo
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