Avances y limitaciones en la selección de embriones humanos : aneuploidías, mosaicismos y enfermedades poligénicas

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El test genético preimplantacional (PGT) consiste de un conjunto de análisis genómicos que ayudan a decidir qué embriones transferir al útero durante la fertilización in vitro. En el primer capítulo de esta tesis, analizamos la posibilidad de realizar el PGT de aneuploidías (PGT-A) con datos generad...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor principal: Berros, Juan Manuel
Otros Autores: Dopazo, Hernán Javier
Formato: Tesis doctoral publishedVersion
Lenguaje:Español
Publicado: Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales 2022
Materias:
TEST GENETICO PREIMPLANTACIONAL
PUNTAJE DE RIESGO POLIGENICO
SELECCION DE EMBRIONES
ANEUPLOIDIA
MOSAICISMO
RASGO CUANTITATIVO
PLEIOTROPIA
CORRELACIÓN GENETICA
GENETICA DE POBLACIONES
MEDICINA REPRODUCTIVA
PREIMPLANTATION GENETIC TESTING
POLYGENIC RISK SCORE
EMBRYO SELECTION
ANEUPLOIDY
MOSAICISM
QUANTITATIVE TRAIT
PLEIOTROPY
GENETIC CORRELATION
POPULATION GENETICS
REPRODUCTIVE MEDICINE
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n7194_Berros
Aporte de:
Biblioteca Digital - Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA) de Universidad de Buenos Aires
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spelling tesis:tesis_n7194_Berros2025-03-31T21:52:00Z Avances y limitaciones en la selección de embriones humanos : aneuploidías, mosaicismos y enfermedades poligénicas Advances and limitations in human embryo selection : aneuploidy, mosaicism and polygenic disease Berros, Juan Manuel Dopazo, Hernán Javier TEST GENETICO PREIMPLANTACIONAL PUNTAJE DE RIESGO POLIGENICO SELECCION DE EMBRIONES ANEUPLOIDIA MOSAICISMO RASGO CUANTITATIVO PLEIOTROPIA CORRELACIÓN GENETICA GENETICA DE POBLACIONES MEDICINA REPRODUCTIVA PREIMPLANTATION GENETIC TESTING POLYGENIC RISK SCORE EMBRYO SELECTION ANEUPLOIDY MOSAICISM QUANTITATIVE TRAIT PLEIOTROPY GENETIC CORRELATION POPULATION GENETICS REPRODUCTIVE MEDICINE El test genético preimplantacional (PGT) consiste de un conjunto de análisis genómicos que ayudan a decidir qué embriones transferir al útero durante la fertilización in vitro. En el primer capítulo de esta tesis, analizamos la posibilidad de realizar el PGT de aneuploidías (PGT-A) con datos generados por la tecnología genotyping-by-sequencing (GBS). Desarrollamos modelos matemáticos basados en el BAF (Ballele frequency), simulamos aneuploidías de diverso tipo y niveles de mosaicismo, y diseñamos tests estadísticos para su detección. Los tests desarrollados logran una detección de aneuploidías con estándares actuales. En el segundo capítulo, analizamos las limitaciones que impone la pleiotropía en el PGT de riesgo de enfermedades poligénicas (PGT-P), un test nuevo y controversial de selección de embriones según su riesgo de enfermedades multifactoriales. Encontramos 14 pares de enfermedades con puntajes poligénicos de riesgo (PRS) correlacionados negativamente en población europea. Mediante una simulación de embriones, hallamos que en 9 de esos pares la selección del embrión de PRS mínimo de una enfermedad por parte de una pareja implicaría un aumento inesperado del riesgo de otra enfermedad en el embrión elegido. Preimplantation genetic testing (PGT) consists of a group of genomic analyses which help decide which embryos should be transferred to the uterus during in vitro fertilization. In the first chapter of this thesis, we analyze the possibility of performing a PGT for aneuploidy (PGT-A) from data generated with the technology genotyping-by-sequencing (GBS). We developed mathematical models based on the BAF (B allele frequency), we simulated aneuploidies of multiple types and mosaicism levels, and we designed statistical tests for their detection. The tests detect aneuploidy with the current standards. In the second chapter, we analyze the limitations imposed by pleiotropy on the PGT for polygenic disease risk (PGT-P), a recently introduced and controversial test that selects embryos based on their estimated risk of several multifactorial diseases. We found 14 pairs of diseases that have negatively correlated polygenic risk scores (PRS) in the European population. Through a simulation of embryos, we found that in 9 of those pairs, if a couple selects the embryo with minimum PRS of a disease, this would entail an unexpected increase in the risk of other disease in the chosen embryo. Fil: Berros, Juan Manuel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales 2022-10-13 info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:ar-repo/semantics/tesis doctoral info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf spa info:eu-repo/semantics/restrictedAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n7194_Berros
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