Diversidad y distribución cromosómica de retroelementos no-LTR en especies de Arachis (Leguminosae) con genoma A

Los retroelementos forman parte del ADN repetitivo y juegan un papel importante tanto en la evolución como en la estructura de los genomas de las plantas. La sección Arachis está formada por 31 especies agrupadas en cinco genomas (A, B, D, F y K), con 29 especies diploides silvestres y 2 especies al...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales:	Samoluk, Sergio Sebastián, Carisimo, Diego, A., Seijo, José Guillermo
Formato:	Reunión
Lenguaje:	Español
Publicado:	Universidad Nacional del Nordeste Secretaría General de Ciencia y Técnica 2024
Materias:	Lines Secuencias repetidas Hibridación in situ fluorescente
Acceso en línea:	http://repositorio.unne.edu.ar/handle/123456789/56149
Aporte de:	RIUNNE - Repositorio Institucional de la Universidad Nacional del Nordeste (UNNE) de Universidad Nacional del Nordeste

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spelling	I48-R184-123456789-561492025-03-06T11:29:00Z Diversidad y distribución cromosómica de retroelementos no-LTR en especies de Arachis (Leguminosae) con genoma A Samoluk, Sergio Sebastián Carisimo, Diego, A. Seijo, José Guillermo Lines Secuencias repetidas Hibridación in situ fluorescente Los retroelementos forman parte del ADN repetitivo y juegan un papel importante tanto en la evolución como en la estructura de los genomas de las plantas. La sección Arachis está formada por 31 especies agrupadas en cinco genomas (A, B, D, F y K), con 29 especies diploides silvestres y 2 especies alotetraploides. A pesar de que existe una colinearidad conservada de diferentes marcadores moleculares entre las especies de Arachis con diferentes genomas, análisis de GISH sugieren una gran divergencia a nivel de secuencia. Sobre estas bases, se ha planteado la hipótesis de que la fracción repetitiva de ADN puede haber impulsado o participado en la diferenciación del genoma de Arachis. Considerando estos antecedentes, y como primer paso para poner a prueba esta hipótesis, se analizó la diversidad de un grupo de LINEs (retroelementos no-LTR) en 3 especies de la sección Arachis que pertenecen al genoma A (A. duranensis, A. helodes y A. cardenasii). Para este propósito, se aislaron por PCR 15 secuencias de la región conservada del gen de la transcriptasa reversa a partir de ADN genómico de las 3 especies utilizando oligonucleótidos degenerados. Las secuencias amplificadas mostraron un 81% de variabilidad nucleotídica y codones de stop en el 40% de las secuencias alineadas. Sin embargo, tenían una alta homología a nivel de aminoácidos. Estas secuencias también mostraron una alta homología con los motivos aminoacídicos de la transcriptasa reversa con LINEs presentes en otras angiospermas y gimnospermas. A pesar de la amplia distribución de estos elementos en diferentes grupos de plantas, el dendograma Neighbor- Joining reveló que las secuencias de Arachis forman un único grupo, aunque se observaron subclusters no específicos de especie. Esta agrupación sugiere que la diversificación de los elementos presentes en Arachis tuvo lugar antes del origen del genoma A. La hibridación in situ fluorescente reveló un patrón de señales débiles y dispersas en la mayor parte de los cromosomas de las tres especies analizadas, lo que sugiere que a pesar de que estos elementos son ubicuos, tienen una baja representación en el genoma A. 2024-10-15T15:15:30Z 2024-10-15T15:15:30Z 2013-06-12 Reunión Samoluk, Sergio Sebastián, Carisimo, Diego, A. y Seijo, José Guillermo, 2013. Diversidad y distribución cromosómica de retroelementos no-LTR en especies de Arachis (Leguminosae) con genoma A. En: XIX Reunión de Comunicaciones Científicas y Tecnológicas Edición 2013. Resistencia: Universidad Nacional del Nordeste. Secretaría General de Ciencia y Técnica, p. 1-1. http://repositorio.unne.edu.ar/handle/123456789/56149 spa UNNE/PI/F008-2011/AR. Corrientes/Análisis genómicos y epigenéticos en el germoplasma de maní. openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ application/pdf p. 1-1 application/pdf Universidad Nacional del Nordeste Secretaría General de Ciencia y Técnica
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