Estudios en expresión génica diferencial y genómica comparativa en yerba mate y yerba señorita

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Ilex paraguariensis (la yerba mate) e I. dumosa (la yerba señorita) son árboles dioicos nativos del sur de Sudamérica. La yerba mate posee enorme relevancia cultural y socio-económica para nuestro país. La yerba señorita exhibe características biológicas que la hacen atractiva para el mejoramiento d...

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Detalles Bibliográficos
Autor principal: Cascales, Jimena
Otros Autores: Gottlieb, Alexandra M.
Formato: Tesis doctoral publishedVersion
Lenguaje:Español
Publicado: Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales 2018
Materias:
LLEX
YERBA MATE
YERBA SEÑORITA
PLASTOMAS
FILOGENOMICA
EPIGENETICA
EXPRESION GENICA DIFERENCIAL
PLASTOMES
PHYLOGENOMICS
EPIGENETICS
GENE EXPRESSION
Acceso en línea:https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n6449_Cascales
http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=aextesis&d=tesis_n6449_Cascales_oai
Aporte de:
Repositorio Digital de la Universidad de Buenos Aires (UBA) de Universidad de Buenos Aires
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description Ilex paraguariensis (la yerba mate) e I. dumosa (la yerba señorita) son árboles dioicos nativos del sur de Sudamérica. La yerba mate posee enorme relevancia cultural y socio-económica para nuestro país. La yerba señorita exhibe características biológicas que la hacen atractiva para el mejoramiento de la yerba mate. En esta Tesis se propusieron dos objetivos principales. El primero involucra la secuenciación y caracterización completa de los plastomas. Esta información será de gran utilidad para aplicar tecnologías de mejoramiento modernas, y para proponer marcadores moleculares especie-específicos realmente variables. El segundo objetivo refiere al estudio comparativo de la epigenética y la expresión génica diferencial, a nivel inter- e intraespecífico, y entre distintos órganos y sexos. Además, se propone la identificación de genes o regiones con expresión o regulación diferencial. Los plastomas obtenidos mostraron estructura conservada, 99% de identidad nucleotídica y sintenia. Se desarrollaron 30 marcadores microsatélite y seleccionaron 16 regiones de utilidad filogenética comprobada. Los perfiles epigenéticos de las muestras evidenciaron agrupamientos de acuerdo a la planta donante, basada en una correlación positiva significativa entre la variación genética y la epigenética. Los patrones de expresión génica diferencial tendieron a agrupar las muestras según el tipo de órgano considerado. No se encontraron evidencias de asociación con mecanismos de determinación sexual. Se identificaron 30 fragmentos diferenciales con funciones metabólicas, de biosíntesis de compuestos, regulación de la expresión, defensa y resistencia a estrés biótico y abiótico, entre otras.
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