Estudio de la resistencia A Sclerotinia sclerotiorum en líneas endocriadas de girasol

Sclerotinia head rot (SHR) caused by Sclerotinia sclerotiorum is one of the most important limiting factors in sunflower crop. This study aimed to identify regions of the sunflower genome associated with resistance to SHR, in order to support the development of assisted breeding strategies to accele...

Descripción completa

Guardado en:
Detalles Bibliográficos
Autor principal: Zubrzycki, Jeremías Enrique
Otros Autores: Cervigni, Gerardo
Formato: Tesis doctoral acceptedVersion
Lenguaje:Español
Publicado: Facultad de Farmacia y Bioquímica 2015
Materias:
Sclerotinia sclerotiorum
Podredumbre húmeda del capítulo
Girasol
Mapeo de QTL
SNPs
Genes candidatos
Sclerotinia sclerotorium
Sclerotinia Head Rot
Sunflower
QTL mapping
Candidate genes
Ciencia de la vida
Acceso en línea:http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=posgraafa&cl=CL1&d=HWA_1131
http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/posgraafa/index/assoc/HWA_1131.dir/1131.PDF
Aporte de:
Repositorio Digital de la Universidad de Buenos Aires (UBA) de Universidad de Buenos Aires
id I28-R145-HWA_1131
record_format dspace
spelling I28-R145-HWA_11312019-09-25 Sclerotinia head rot (SHR) caused by Sclerotinia sclerotiorum is one of the most important limiting factors in sunflower crop. This study aimed to identify regions of the sunflower genome associated with resistance to SHR, in order to support the development of assisted breeding strategies to accelerate the process of creating new genotypes with resistance to this disease. A population of 135 Recombinant Inbred Lines was genotyped using a collection of SNP markers associated to putative stress resistance genes. The new genetic map build has 2823.8 cM and an average density of 4.57 cM loci. We also conducted field evaluations. A total of 36 QTL distributed along 13 linkage groups were identified. The dispersion in the genome of the QTLs identified for the characters confirmed how vast and complex genetic base for sunflower resistance to SHR is. This thesis has deepened the knowledge of these regions and highlights the importance of the contribution of pointed sources in LG 10 and 15, which are presented as candidates to be analyzed in detail to advance in the identification of responsible genes that contribute to understand the complexity of resistance genetic basis. Fil: Zubrzycki, Jeremías Enrique. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina Cervigni, Gerardo Rivolta, Carina Facultad de Farmacia y Bioquímica Paniego, Norma Zubrzycki, Jeremías Enrique 2015-03-12 La podredumbre húmeda del capítulo (PHC), causada por Sclerotinia sclerotiorum, es una de las limitante más importantes para el cultivo del girasol. Este trabajo tuvo como objetivo identificar las regiones del genoma de girasol asociadas a resistencia a PHC a partir de una estrategia de mapeo de QTL sobre una población de líneas recombinantes endocriadas. Se construyó un nuevo mapa genético incorporando marcadores de tipo SNP sobre un mapa existente, se caracterizó el comportamiento fenotípico de la población utilizando infecciones asistidas del patógeno durante cuatro campañas. Se registraron los datos de incidencia, severidad, intensidad y período de incubación. El mapa resultante posee 2823,8 cM y una densidad media de 4,57 cM por loci. Se identificaron 36 QTLs distribuidos en 13 grupos de ligamiento, destacándose dos regiones sobre los GL10 y 15, por su expresión consistente en las diferentes campañas. Los marcadores asociados a estas regiones podrán ser usados por los programas de mejoramiento en el desarrollo de genotipos con mejor desempeño ante el PHC. Asimismo, estos QTL se presentan como candidatos a ser estudiados en profundidad para caracterizar los componentes funcionales responsables de la expresión del fenotipo de interés. application/pdf Miranda, María V. López, César Gallego, Susana Sclerotinia sclerotiorum Podredumbre húmeda del capítulo Girasol Mapeo de QTL SNPs Genes candidatos Sclerotinia sclerotorium Sclerotinia Head Rot Sunflower QTL mapping SNPs Candidate genes spa Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica info:eu-repo/semantics/openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ Ciencia de la vida Estudio de la resistencia A Sclerotinia sclerotiorum en líneas endocriadas de girasol info:eu-repo/semantics/doctoralThesis info:ar-repo/semantics/tesis doctoral info:eu-repo/semantics/acceptedVersion http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=posgraafa&cl=CL1&d=HWA_1131 http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/posgraafa/index/assoc/HWA_1131.dir/1131.PDF
institution Universidad de Buenos Aires
institution_str I-28
repository_str R-145
collection Repositorio Digital de la Universidad de Buenos Aires (UBA)
language Español
orig_language_str_mv spa
topic Sclerotinia sclerotiorum
Podredumbre húmeda del capítulo
Girasol
Mapeo de QTL
SNPs
Genes candidatos
Sclerotinia sclerotorium
Sclerotinia Head Rot
Sunflower
QTL mapping
SNPs
Candidate genes
Ciencia de la vida
spellingShingle Sclerotinia sclerotiorum
Podredumbre húmeda del capítulo
Girasol
Mapeo de QTL
SNPs
Genes candidatos
Sclerotinia sclerotorium
Sclerotinia Head Rot
Sunflower
QTL mapping
SNPs
Candidate genes
Ciencia de la vida
Zubrzycki, Jeremías Enrique
Estudio de la resistencia A Sclerotinia sclerotiorum en líneas endocriadas de girasol
topic_facet Sclerotinia sclerotiorum
Podredumbre húmeda del capítulo
Girasol
Mapeo de QTL
SNPs
Genes candidatos
Sclerotinia sclerotorium
Sclerotinia Head Rot
Sunflower
QTL mapping
SNPs
Candidate genes
Ciencia de la vida
description Sclerotinia head rot (SHR) caused by Sclerotinia sclerotiorum is one of the most important limiting factors in sunflower crop. This study aimed to identify regions of the sunflower genome associated with resistance to SHR, in order to support the development of assisted breeding strategies to accelerate the process of creating new genotypes with resistance to this disease. A population of 135 Recombinant Inbred Lines was genotyped using a collection of SNP markers associated to putative stress resistance genes. The new genetic map build has 2823.8 cM and an average density of 4.57 cM loci. We also conducted field evaluations. A total of 36 QTL distributed along 13 linkage groups were identified. The dispersion in the genome of the QTLs identified for the characters confirmed how vast and complex genetic base for sunflower resistance to SHR is. This thesis has deepened the knowledge of these regions and highlights the importance of the contribution of pointed sources in LG 10 and 15, which are presented as candidates to be analyzed in detail to advance in the identification of responsible genes that contribute to understand the complexity of resistance genetic basis.
author2 Cervigni, Gerardo
author_facet Cervigni, Gerardo
Zubrzycki, Jeremías Enrique
format Tesis doctoral
Tesis doctoral
acceptedVersion
author Zubrzycki, Jeremías Enrique
author_sort Zubrzycki, Jeremías Enrique
title Estudio de la resistencia A Sclerotinia sclerotiorum en líneas endocriadas de girasol
title_short Estudio de la resistencia A Sclerotinia sclerotiorum en líneas endocriadas de girasol
title_full Estudio de la resistencia A Sclerotinia sclerotiorum en líneas endocriadas de girasol
title_fullStr Estudio de la resistencia A Sclerotinia sclerotiorum en líneas endocriadas de girasol
title_full_unstemmed Estudio de la resistencia A Sclerotinia sclerotiorum en líneas endocriadas de girasol
title_sort estudio de la resistencia a sclerotinia sclerotiorum en líneas endocriadas de girasol
publisher Facultad de Farmacia y Bioquímica
publishDate 2015
url http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=posgraafa&cl=CL1&d=HWA_1131
http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/posgraafa/index/assoc/HWA_1131.dir/1131.PDF
work_keys_str_mv AT zubrzyckijeremiasenrique estudiodelaresistenciaasclerotiniasclerotiorumenlineasendocriadasdegirasol
_version_ 1766017452796280832

Ejemplares similares