Comparación de 3 kits de real time RT-PCR para detección de SARS-CoV-2

The objective of the present study was to evaluate the diagnostic performance of 3 commercial SARS-CoV-2 real time RT-PCR detection kits on nasopharyngeal swab samples, using the majority criterion. One hundred RNA samples informed as detectable (n=50) and not detectable (n=50) with GeneFinder-COVID...

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Detalles Bibliográficos
Autores principales: MORÉ, Gastón, TIZZANO, Marco Antonio, RAMBEAUD, Magdalena, PANEI, Carlos Javier, FUENTEALBA, Nadia, ASPITIA, Carolina, BRAVI, Maria Emilia, ORIGLIA, Javier, RUDD GARCÉS, Gabriela, GOLIJOW, Carlos, UNZAGA, Juan Manuel, PECORARO, Marcelo
Formato: Artículo revista
Lenguaje:Español
Publicado: Universidad Nacional del Litoral 2021
Materias:
Molecular diagnosis
GeneFinder
BGI
DisCoVery
SARS-CoV-2
Diagnóstico molecular
Acceso en línea:https://bibliotecavirtual.unl.edu.ar/publicaciones/index.php/FAVEveterinaria/article/view/10131
Aporte de:
Biblioteca Virtual - Publicaciones (UNL) de Universidad Nacional del Litoral
id I26-R133-article-10131
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spelling I26-R133-article-101312023-09-15T10:33:50Z Comparación de 3 kits de real time RT-PCR para detección de SARS-CoV-2 Comparison of 3 real time RT-PCR kits for SARS-CoV-2 detection MORÉ, Gastón TIZZANO, Marco Antonio RAMBEAUD, Magdalena PANEI, Carlos Javier FUENTEALBA, Nadia ASPITIA, Carolina BRAVI, Maria Emilia ORIGLIA, Javier RUDD GARCÉS, Gabriela GOLIJOW, Carlos UNZAGA, Juan Manuel PECORARO, Marcelo Molecular diagnosis GeneFinder BGI DisCoVery SARS-CoV-2 Diagnóstico molecular GeneFinder BGI DisCoVery SARS-CoV-2 The objective of the present study was to evaluate the diagnostic performance of 3 commercial SARS-CoV-2 real time RT-PCR detection kits on nasopharyngeal swab samples, using the majority criterion. One hundred RNA samples informed as detectable (n=50) and not detectable (n=50) with GeneFinder-COVID-19 Plus RealAmp were selected, and later analyzed with BGI-Real-Time Fluorescent for Detecting SARS-CoV-2 and DisCoVery-SARS-CoV-2 RT-PCR. Agreement between tests was almost perfect; sensitivity was 100% for Genefinder and DisCoVery and less than 90% for BGI. Real time PCR products from 10 discordant samples were further analyzed by agarose gel electrophoresis, confirming 3 false negatives by BGI and suggesting 5 samples as true positives by DisCoVery. The use of DisCoVery and GeneFinder™ appear as an excellent choice with good sensitivity and specificity values. El objetivo de este trabajo fue analizar la performance de 3 kits comerciales de real time RT-PCR para la detección de SARS-CoV-2 en muestras de hisopados nasofaríngeos, mediante el criterio de mayoría. Se seleccionaron 100 muestras de ARN informadas en el SISA como detectables (n=50) o no detectables (n=50) con el GeneFinder-COVID-19 Plus RealAmp, que fueron posteriormente analizadas mediante el BGI-Real-Time Fluorescent for Detecting SARS-CoV-2 y el DisCoVery-SARS-CoV-2 RT-PCR. Los niveles de concordancia fueron de buenos a excelentes; Genefinder y DisCoVery presentaron sensibilidad del 100%, mientras que BGI presentó una sensibilidad menor al 90%. Se analizaron los productos de 10 muestras discordantes o dudosas mediante electroforesis en gel de agarosa. Se confirmaron 3 muestras como falsos negativos del BGI y 5 muestras detectables al DisCoVery se presumen como verdaderos positivos. El uso de los kits DisCoVery y GeneFinder™ se presenta como una excelente opción, con buenos valores de sensibilidad y especificidad. Universidad Nacional del Litoral 2021-07-07 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Comunicación corta Short communication application/pdf https://bibliotecavirtual.unl.edu.ar/publicaciones/index.php/FAVEveterinaria/article/view/10131 10.14409/favecv.v20iSuppl..10131 FAVE Sección Ciencias Veterinarias; Vol. 20 Núm. Suppl. (2021): FAVE Sección Ciencias Veterinarias - Suplemento: Ciencias Veterinarias y COVID-19; 3-8 FAVE Sección Ciencias Veterinarias; Vol. 20 No. Suppl. (2021): FAVE Sección Ciencias Veterinarias - Supplement; 3-8 FAVE Sección Ciencias Veterinarias; v. 20 n. Suppl. (2021): FAVE Sección Ciencias Veterinarias - Suplemento; 3-8 2362-5589 1666-938X 10.14409/favecv.v20iSuppl. spa https://bibliotecavirtual.unl.edu.ar/publicaciones/index.php/FAVEveterinaria/article/view/10131/14050 Derechos de autor 2021 Gastón MORÉ, Marco Antonio TIZZANO, Magdalena RAMBEAUD, Carlos Javier PANEI, Nadia FUENTEALBA, Carolina ASPITIA, Maria Emilia BRAVI, Javier ORIGLIA, Gabriela RUDD GARCÉS, Carlos GOLIJOW, Juan Manuel UNZAGA, Marcelo PECORARO
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