Infecciones persistentes por SARS-CoV-2 en inmunosuprimidos: reporte de casos en Córdoba

The SARS-CoV-2 virus, responsible for the COVID-19 pandemic, is the causal agent of acute respiratory disease. Immunocompromised persons may develop more severe respiratory symptoms and cases of persistent infections have been reported. The objective of this work was to describe 3 cases of...

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Detalles Bibliográficos
Autores principales: Pisano, MB, Sicilia, P, Castro, GM, Konigheim, BS, Cechetto, E, López, L, Barbás, MG, Ré, VE
Formato: Artículo revista
Publicado: Universidad Nacional Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Secretaria de Ciencia y Tecnología 2022
Materias:
SARS-CoV-2
persistent infection
immunosuppressed
viral variants
SARS CoV-2
infección persistente
inmunosuprimidos
variantes virales
Acceso en línea:https://revistas.unc.edu.ar/index.php/med/article/view/39036
Aporte de:
Revista de la Facultad de Ciencias Médicas de Córdoba de Universidad Nacional de Córdoba
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description The SARS-CoV-2 virus, responsible for the COVID-19 pandemic, is the causal agent of acute respiratory disease. Immunocompromised persons may develop more severe respiratory symptoms and cases of persistent infections have been reported. The objective of this work was to describe 3 cases of persistent SARS-CoV-2 infections in immunosuppressed individuals from Córdoba. Case 1: HIV+ patient, male, 50 years old, positive for SARS-CoV-2 by real-time RT-PCR in an oropharyngeal swab sample (HOF) on 12/11/2021 (Ct=29.3), presenting respiratory symptoms. Repeated samples taken on 13/12/2021, 28/12/2021 and 7/1/2022 were positive, with Cts of 23.6, 23.2 and 28.6, respectively. The complete viral genome was sequenced in the sample from 13/12, and presented an infrequent mutation profile; the lineage could not be determined. No further clinical information could be obtained. Case 2: patient with Lupus, female, 47 years old, positive for SARS-CoV-2 by real-time RT-PCR in HOF on 27/12/2021 (Ct=29.2), when she presented dyspnea, headache, odynophagia, cough, anosmia and rhinitis. The typing by Real-time RT-PCR indicated infection by the variant of interest (VOI) Lambda. Subsequent detections were positive: 19/1/2022 (Ct=22), 24/1/2022 (Ct=25.8), 29/1/2022 (Ct=23.5), 4/2/2022 (Ct =23.7). The sample from 19/1 was re-typed and the complete genome was sequenced, resulting in VOI Lambda by both techniques. Furthermore, this sample was isolated in Vero cl76 cells, confirming viral infectivity. No further clinical information could be obtained. Case 3: HIV+ patient, female, 32 years old. Positive for SARS-CoV-2 by real-time RT-PCR in HOF on 5/2/2022 (Ct=24.3), when fever, headache, cough, sore throat, and dyspnea were present, and in subsequent samples: 17/2/2022 (Ct=20.7), 24/2/2022 (Ct=19.1), 14/4/2022 (Ct=25), 20/4/2022 (Ct=20.6) and 27/4/2022 (Ct=21.6). Complete genome sequences were obtained in samples from 24/2 and 20/4, resulting in the variant of concern (VOC) Omicron, lineage BA.1.15. Until 20/4, the patient had fever, cough, myalgia, diarrhea, vomiting, and abdominal pain. This work describes, for the first time, persistent SARS-CoV-2 infections in immunosuppressed patients from Córdoba, in accordance with reports from other countries, alerting the health team about their occurrence to perform an active clinical monitoring. This population could constitute a reservoir for the emergence of new viral variants.
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Repeated samples taken on 13/12/2021, 28/12/2021 and 7/1/2022 were positive, with Cts of 23.6, 23.2 and 28.6, respectively. The complete viral genome was sequenced in the sample from 13/12, and presented an infrequent mutation profile; the lineage could not be determined. No further clinical information could be obtained. Case 2: patient with Lupus, female, 47 years old, positive for SARS-CoV-2 by real-time RT-PCR in HOF on 27/12/2021 (Ct=29.2), when she presented dyspnea, headache, odynophagia, cough, anosmia and rhinitis. The typing by Real-time RT-PCR indicated infection by the variant of interest (VOI) Lambda. Subsequent detections were positive: 19/1/2022 (Ct=22), 24/1/2022 (Ct=25.8), 29/1/2022 (Ct=23.5), 4/2/2022 (Ct =23.7). The sample from 19/1 was re-typed and the complete genome was sequenced, resulting in VOI Lambda by both techniques. Furthermore, this sample was isolated in Vero cl76 cells, confirming viral infectivity. No further clinical information could be obtained. Case 3: HIV+ patient, female, 32 years old. Positive for SARS-CoV-2 by real-time RT-PCR in HOF on 5/2/2022 (Ct=24.3), when fever, headache, cough, sore throat, and dyspnea were present, and in subsequent samples: 17/2/2022 (Ct=20.7), 24/2/2022 (Ct=19.1), 14/4/2022 (Ct=25), 20/4/2022 (Ct=20.6) and 27/4/2022 (Ct=21.6). Complete genome sequences were obtained in samples from 24/2 and 20/4, resulting in the variant of concern (VOC) Omicron, lineage BA.1.15. Until 20/4, the patient had fever, cough, myalgia, diarrhea, vomiting, and abdominal pain. This work describes, for the first time, persistent SARS-CoV-2 infections in immunosuppressed patients from Córdoba, in accordance with reports from other countries, alerting the health team about their occurrence to perform an active clinical monitoring. This population could constitute a reservoir for the emergence of new viral variants. El virus SARS-CoV-2, responsable de la pandemia de COVID-19, es agente causal de enfermedad respiratoria aguda. Las personas inmunocomprometidas pueden desarrollar síntomas respiratorios más severos y se han reportado casos de infecciones persistentes. El objetivo fue describir 3 casos de infecciones persistentes por SARS-CoV-2 en individuos inmunosuprimidos de Córdoba. Caso 1: paciente HIV+, sexo M, 50 años, positivo para SARS-CoV-2 por RT-PCR en tiempo real en muestra de hisopado orofaríngeo (HOF) el 12/11/2021 (Ct=29,3), presentando síntomas respiratorios. Repetidas muestras tomadas los días 13/12/2021, 28/12/2021 y 7/1/2022 resultaron positivas, con Cts de 23,6, 23,2 y 28,6, respectivamente. Se secuenció el genoma completo en la muestra del 13/12, presentando un perfil de mutaciones poco frecuente, sin poder determinarse el linaje. No pudo obtenerse más información clínica. Caso 2: paciente con Lupus, sexo F, 47 años, positiva para SARS-CoV-2 por RT-PCR en tiempo real en HOF del 27/12/2021 (Ct=29,2), momento en el que presentó disnea, cefalea, odinofagia, tos, anosmia y rinitis. La tipificación por RT-PCR en tiempo real indicó infección con variante Lambda. Las detecciones posteriores resultaron positivas: 19/1/2022 (Ct=22), 24/1/2022 (Ct=25,8), 29/1/2022 (Ct=23,5), 4/2/2022 (Ct=23,7). La muestra del 19/1 fue re-tipificada y se secuenció el genoma completo, resultando en variante Lambda por ambas técnicas. Además, esta muestra fue aislada en células Vero cl76, confirmando la infectividad viral. No pudo obtenerse más información clínica. Caso 3: paciente HIV+, sexo F, 32 años. Positivo para SARS-CoV-2 por RT-PCR en tiempo real en HOF el 5/2/2022 (Ct=24,3), cuando presentó fiebre, cefalea, tos, odinofagia y disnea, y en las muestras posteriores: 17/2/2022 (Ct=20,7), 24/2/2022 (Ct=19,1), 14/4/2022 (Ct=25), 20/4/2022 (Ct=20,6) y 27/4/2022 (Ct=21,6). Se obtuvieron las secuencias del genoma completo en las muestras del 24/2 y 20/4, resultando variante Omicron, linaje BA.1.15. Hasta el 20/4, la paciente presentaba fiebre, tos, mialgia, diarrea, vómitos y dolor abdominal. Este trabajo describe por primera vez infecciones persistentes por SARS-CoV-2 en pacientes inmunosuprimidos de Córdoba, en concordancia con reportes de otros países, alertando al equipo de salud sobre su ocurrencia para el monitoreo clínico activo. Esta población podría constituir un reservorio para la emergencia de nuevas variantes virales.   Universidad Nacional Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Secretaria de Ciencia y Tecnología 2022-10-26 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion texto texto texto https://revistas.unc.edu.ar/index.php/med/article/view/39036 Revista de la Facultad de Ciencias Médicas de Córdoba.; Vol. 79 No. Suplemento JIC XXIII (2022): Suplemento JIC XXIII Revista de la Facultad de Ciencias Médicas de Córdoba; Vol. 79 Núm. Suplemento JIC XXIII (2022): Suplemento JIC XXIII Revista da Faculdade de Ciências Médicas de Córdoba; v. 79 n. Suplemento JIC XXIII (2022): Suplemento JIC XXIII 1853-0605 0014-6722 http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0

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