Desarrollo y aplicación de primers para detección de rotavirus G3-Equine-Like y caracterización del gen VP7 en niños, Córdoba 2023–2024
Rotavirus es un virus de RNA doble cadena segmentado que codifica múltiples proteínas, incluyendo VP7, que determina el genotipo Gx. Los genotipos humanos comunes incluyen G1-G4, G8, G9 y G12. Desde 2015, una nueva cepa G3 Equine-Like, con un 91% de homología con la cepa equina G3, ha estado circu...
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| Formato: | Artículo revista |
| Lenguaje: | Español |
| Publicado: |
Universidad Nacional Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Secretaria de Ciencia y Tecnología
2025
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| Materias: | |
| Acceso en línea: | https://revistas.unc.edu.ar/index.php/med/article/view/50468 |
| Aporte de: |
| Sumario: | Rotavirus es un virus de RNA doble cadena segmentado que codifica múltiples proteínas, incluyendo VP7, que determina el genotipo Gx. Los genotipos humanos comunes incluyen G1-G4, G8, G9 y G12. Desde 2015, una nueva cepa G3 Equine-Like, con un 91% de homología con la cepa equina G3, ha estado circulando en varios países, pero no está incluida en los métodos de detección de la OMS. En Argentina, los resultados iniciales de los casos positivos de rotavirus de 2023 indicaron una alta circulación de G1 a pesar del programa de vacunación Rotarix. Sin embargo, la secuenciación reveló que estos amplicones eran G3 Equine-Like, lo que confirmó una genotipificación errónea en el tamaño del amplicón G1 (genotipificación basada en la metodología de la OMS de 2009). El objetivo del estudio fue diseñar un nuevo conjunto de cebadores específico para cepas G3 Equine-Like para la detección de rutina.
Este enfoque se empleó para caracterizar molecularmente las cepas G3 Equine-Like circulantes en Córdoba, Argentina, durante el período 2023-2024. Se utilizaron secuencias de la base de datos del NCBI, publicaciones y VP7 previamente genotipadas de Argentina para diseñar un conjunto de cebadores dirigidos al gen de la proteína VP7. La especificidad del conjunto de cebadores se evaluó frente a otros genotipos de rotavirus, así como con bacterias y virus entéricos.
Los cebadores produjeron una única banda de 230 pb en gel de agarosa sin reactividad cruzada. Las muestras originalmente identificadas como G1 se confirmaron como G3 Equine-Like, lo que enfatiza su papel etiológico clave en los casos de rotavirus. La secuenciación reveló tres cambios de nucleótidos dentro de la región ORF con respecto a las secuencias globales.
La implementación del nuevo conjunto de cebadores demostró ser una herramienta poderosa para la detección rutinaria del rotavirus G3 Equine-Like; sin embargo, el impacto de los cambios de nucleótidos necesita una evaluación más a fondo.
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